A Seção de Educação Especial tem como missão colaborar de forma qualitativa com os profissionais das Unidades Escolares municipais que atuam diretamente com os alunos com deficiência e/ou em processo de investigação diagnóstica, oferecendo subsídios para que estes possam proporcionar situações educativas de modo que os alunos possam desenvolver suas habilidades cognitivas e socioemocionais que dão sustentação à aprendizagem e ao desenvolvimento humano ao longo da vida. O objetivo da Seção está em colaborar com a Secretaria Municipal de Educação na realização de Formação Continuada para Agentes Educacionais que atuam diretamente com alunos com deficiência e professores, tendo como objetivo favorecer o processo de inclusão dos alunos, que ocorrerão por meio da elaboração e execução de ações institucionais e terapêuticas, através dos seus quatro programas: Equipe Multiprofissionais (especialistas), Intérpretes de LIBRAS, Sala de Recursos Multifuncionais, Programa de Integração da Coletividade (P.I.C.) e Formação Continuada em Educação Inclusiva. A Seção é composta por Chefe da Seção, Supervisora da Educação Inclusiva, 3 (três) Psicólogas, 3(três) Psicopedagogas, 1 (uma) Fonoaudióloga, 4 (quatro) intérpretes de LIBRAS, 4 (quatro) Educadores Físicos – Especialistas em Atividades Aquáticas.